Lagre grafer til harddisken

Araz Rawshani

Lagre ggplot()-grafer

Med funksjonen ggsave() lagrer du en graf fra R til datamaskinens harddisk. Hvis du har lagret grafen i et objekt, kan du angi objektets navn med argumentet plot i ggsave(). Hvis du ikke angir et objekt for plot, vil ggsave() lagre den sist genererte grafen. Da bør ggsave() plasseres rett etter koden for grafen som skal lagres.

I eksemplene nedenfor lagrer vi den siste grafen automatisk i ulike filformater. Merk at det ikke er noe + mellom ggplot() og ggsave().

## Lagrer i PNG-format
ggplot(gapminder, aes(x=pop, y=lifeExp)) + geom_point()
ggsave('Min-figur.png')

## Lagrer i PDF-format
ggplot(gapminder, aes(x=pop, y=lifeExp)) + geom_point()
ggsave('Min-figur.pdf')

## Lagrer i JPEF-format
ggplot(gapminder, aes(x=pop, y=lifeExp)) + geom_point()
ggsave('Min-figur.jpeg')

## Lagrer i SVG-format
ggplot(gapminder, aes(x=pop, y=lifeExp)) + geom_point()
ggsave('Min-figur.svg')

## Lagrer i EPS-format
ggplot(gapminder, aes(x=pop, y=lifeExp)) + geom_point()
ggsave('Min-figur.eps')

## Lagrer i BMP-format
ggplot(gapminder, aes(x=pop, y=lifeExp)) + geom_point()
ggsave('Min-figur.bmp')

## Lagrer i TIFF-format
ggplot(gapminder, aes(x=pop, y=lifeExp)) + geom_point()
ggsave('Min-figur.tiff')

## Lagrer i PS-format
ggplot(gapminder, aes(x=pop, y=lifeExp)) + geom_point()
ggsave('Min-figur.ps')

## Lagrer i PDF-format (kun Windows)
ggplot(gapminder, aes(x=pop, y=lifeExp)) + geom_point()
ggsave('Min-figur.wmf')

I neste eksempel lager vi et objekt (my_plot) fra ggplot(), og deretter angir vi i ggsave() at vi vil lagre nettopp det objektet.

my_plot <- ggplot(gapminder, aes(x=pop, y=lifeExp)) + geom_point()
ggsave(plot="my_plot", filename="my_plot.png")

Funksjonen ggsave() har en rekke argumenter som kan justeres etter behov:

Argument	Funksjon
`filename`	File name to create on disk.
`plot`	Plot to save, defaults to last plot displayed.
`device`	Device to use. Can either be a device function, or one of "eps", "ps", "tex" (pictex), "pdf", "jpeg", "tiff", "png", "bmp", "svg" or "wmf" (windows only).
`path`	Path of the directory to save plot to: `path` and `filename`are combined to create the fully qualified file name. Defaults to the working directory.
`scale`	Multiplicative scaling factor.
`width, height, units`	Plot size in `units` ("in", "cm", "mm", or "px"). If not supplied, uses the size of current graphics device.
`dpi`	Plot resolution. Also accepts a string input: "retina" (320), "print" (300), or "screen" (72). Applies only to raster output types.
`limitsize`	When `TRUE` (the default), `ggsave()` will not save images larger than 50x50 inches, to prevent the common error of specifying dimensions in pixels.
`bg`	Background colour. If `NULL`, uses the `plot.background` fill value from the plot theme.

Argumenter i ggsave()

Bredde og høyde

Når du lagrer grafer, hentes høyden og bredden fra det aktuelle utseendet i Rstudio. Derfor er det bedre å angi høyde og bredde i ggsave(). Nedenfor lagres en figur i png-format med 1000 piksler i høyde og bredde.

ggplot(gapminder, aes(x=pop, y=lifeExp)) + geom_point()
ggsave('Min-figur.png', height=1000, width=1000, units = "px")

Hvis du bruker R Markdown til å generere rapporter, kan du angi figurens høyde og bredde i innstillingene for hver chunk. Bildet nedenfor viser at vi angir at grafer skal ha en bredde og høyde på 1000 piksler.

R Markdown-chunk med innstillingene fig.width=1000px og fig.height=1000px etterfulgt av ggplot- og ggsave-kode

Lagre grafer laget med base R

Det er fullt mulig å lage grafer med base R. Det anbefales ikke, ettersom ggplot2 er betydelig bedre. Et eksempel på en graf i base R følger:

plot(100, 200)

Enkel graf i base R med et enkelt punkt ved x 100 og y 200

For å lagre grafer laget i base R må følgende kode brukes:

png('base-R-graf.png', height=500, width=500)
plot(100, 200)
dev.off()

I eksemplet ovenfor lagrer vi bildet i png-format. Før grafen tegnes, bruker vi funksjonen png() til å angi filnavnet, høyden og bredden. Deretter tegnes grafen, og på siste linje (dev.off()) forteller vi at bildet er ferdig og kan lagres.

For å lagre figuren i PDF-format brukes i stedet koden nedenfor. Merk at både "png" i funksjonen og filnavnet er byttet ut med "pdf":

pdf('base-R-graf.pdf', height=500, width=500)
plot(100, 200)
dev.off()